La prueba también identifica en qué parte del cuerpo se originó el cáncer.
Investigadores han desarrollado el primer análisis de sangre que puede detectar con precisión más de 50 tipos de cáncer e identificar en qué tejido se originó el cáncer, a menudo antes de que haya signos o síntomas clínicos de la enfermedad.
En un artículo publicado en la revista Annals of Oncology los investigadores muestran que la prueba, que eventualmente podría usarse en los programas de detección del cáncer, tiene una tasa de falsos positivos del 0.7% para la detección del cáncer, lo que significa que menos del 1% de las personas serían identificadas erróneamente como portadoras de cáncer.
A modo de comparación, aproximadamente el 10% de las mujeres son identificadas erróneamente con cáncer en los programas de detección de cáncer de mama, aunque esta tasa puede ser mayor o menor dependiendo del número y la frecuencia de las pruebas de detección y el tipo de mamografía realizada.
La prueba fue capaz de predecir el tejido en el que se originó el cáncer en el 96% de las muestras, y fue precisa en el 93%.
Los tumores arrojan ADN a la sangre, y esto contribuye a lo que se conoce como ADN libre de células (cfDNA).
Sin embargo, como el cfDNA también puede provenir de otros tipos de células, puede ser difícil determinar el cfDNA que proviene de los tumores.
El análisis de sangre reportado en este estudio analiza cambios químicos en el ADN llamados “metilación” que generalmente controlan la expresión génica.
Los patrones de metilación anormales y los cambios resultantes en la expresión génica pueden contribuir al crecimiento tumoral, por lo que estas señales en el ADNc tienen el potencial de detectar y localizar el cáncer.
El análisis de sangre se dirige a aproximadamente un millón de los 30 millones de sitios de metilación en el genoma humano.
Se utilizó un clasificador de aprendizaje automático para predecir la presencia de cáncer y el tipo de cáncer en función de los patrones de metilación en el ADNc desprendido por los tumores.
El clasificador fue entrenado usando una base de datos de metilación de señales cancerosas y no cancerosas en cfDNA.
Se cree que la base de datos es la más grande del mundo y es propiedad de la compañía involucrada en esta investigación, GRAIL, Inc. (California, EE. UU.).
El autor principal del artículo, el Dr. Michael Seiden (MD, PhD), presidente de US Oncology (Texas, EE. UU.), dijo:
“Nuestra investigación anterior mostró que el enfoque de metilación superó tanto el genoma completo como la secuenciación dirigida en la detección de cáncer mortal de múltiple tipos en todas las etapas clínicas, y en la identificación del tejido de origen.
También nos permitió identificar las regiones más informativas del genoma, que ahora son el objetivo de la prueba de metilación refinada que se informa en este documento “.
En la parte del estudio del Atlas del genoma libre de células circulantes (CCGA) publicado, las muestras de sangre de 6,689 participantes con cáncer no tratado previamente (2482 pacientes) y sin cáncer (4207 pacientes) de América del Norte se dividieron en un conjunto de entrenamiento y uno de validación conjunto.
De estos, los resultados de 4316 participantes estaban disponibles para el análisis: 3052 en el conjunto de entrenamiento (1531 con cáncer, 1521 sin cáncer) y 1264 en el conjunto de validación (654 con cáncer y 610 sin cáncer). Se incluyeron más de 50 tipos de cáncer.
El clasificador de aprendizaje automático analizó muestras de sangre de los participantes para identificar cambios de metilación y clasificar las muestras como cancerosas o no cancerosas, e identificar el tejido de origen.
Los investigadores encontraron que el rendimiento del clasificador era consistente tanto en los conjuntos de entrenamiento como de validación, con una tasa de falsos positivos del 0.7% en el conjunto de validación.
La capacidad del clasificador para identificar correctamente cuándo estaba presente el cáncer (la tasa positiva verdadera) también fue consistente entre los dos conjuntos.
En 12 tipos de cáncer que a menudo son los más mortales (anal, vesical, intestinal, esofágico, estomacal, cabeza y cuello, hígado y vías biliares, cáncer de pulmón, ovario y páncreas, linfoma y cáncer de glóbulos blancos como el mieloma múltiple ), la verdadera tasa positiva fue del 67,3% en los estadios clínicos I, II y III.
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Y, en la actualidad, no hay forma de detección para la mayoría de ellos antes de que aparezcan los síntomas.
La verdadera tasa positiva fue del 43,9% para todos los tipos de cáncer en el estudio en las tres etapas clínicas.
La detección mejoró con cada etapa de cáncer.
En los 12 cánceres especificados previamente, la tasa positiva verdadera fue del 39% en la etapa I, 69% en la etapa II, 83% en la etapa III y 92% en la etapa IV.
En todos los más de 50 tipos de cáncer, las tasas correspondientes fueron 18%, 43%, 81% y 93%, respectivamente.
La prueba también fue consistente entre los conjuntos de entrenamiento y validación en su capacidad para identificar el tejido donde se originó el cáncer, con una precisión del 93% en el conjunto de validación.
El Dr. Seiden dijo:
“Estos datos respaldan la capacidad de esta prueba de metilación dirigida para cumplir con lo que creemos que son los requisitos fundamentales para un análisis de sangre de detección temprana de cáncer múltiple que podría usarse para la detección a nivel de la población:
La capacidad de detectar cáncer mortal de múltiple tipos con una sola prueba que tiene una tasa de falsos positivos muy baja, y la capacidad de identificar en qué parte del cuerpo se encuentra el cáncer con alta precisión para ayudar a los proveedores de atención médica a dirigir los próximos pasos para el diagnóstico y la atención.
“Teniendo en cuenta la carga del cáncer en nuestra sociedad, es importante que continuemos explorando la posibilidad de que esta prueba pueda interceptar cánceres en una etapa más temprana y, por extensión, reducir potencialmente las muertes por cánceres para los que la detección no está disponible o es de pobre adherencia.
Hasta donde sabemos, este es el estudio clínico de genómica más grande, en participantes con y sin cáncer, para desarrollar y validar un análisis de sangre para la detección temprana de cánceres múltiples“.
El estudio está financiado por GRAIL, el fabricante del análisis de sangre.
Los investigadores continúan validando la prueba en grandes estudios prospectivos en los EE. UU. (Estudios STRIVE y PATHFINDER) y el Reino Unido (estudio SUMMIT), y para examinar su viabilidad para el cribado de poblaciones.
Una fortaleza del estudio CCGA es que incluye a más de 15,000 participantes de 142 clínicas en Norteamérica, asegurando que los resultados sean generalizables para una población diversa.
Los estudios en curso evalúan el rendimiento de la prueba en poblaciones aún más amplias.
Las limitaciones incluyen: todos los participantes con cáncer ya habían sido diagnosticados con cáncer (por ejemplo, a través de exámenes de detección o pacientes que presentan síntomas); el estudio no fue diseñado para establecer el impacto de la prueba en la muerte por cáncer u otras causas;
En el momento de este análisis, no todos los pacientes habían sido seguidos durante un año, lo cual es necesario para garantizar que su estado de no cáncer sea exacto; y se produjo cierta inexactitud en la detección del tejido de origen para los cánceres provocados por el virus del papiloma humano (VPH), como los cánceres de cuello uterino, ano y cabeza y cuello; esta información se está utilizando para mejorar el rendimiento de la prueba .
El editor en jefe de Annals of Oncology, profesor Fabrice André, director de investigación del Institut Gustave Roussy, Villejuif, Francia, dijo:
“Este es un estudio histórico y un primer paso hacia el desarrollo de herramientas de detección fáciles de realizar.
La detección temprana de más del 50% de los cánceres podría salvar millones de vidas cada año en todo el mundo y podría reducir drásticamente la morbilidad inducida por los tratamientos agresivos.
“Si bien los números aún son pequeños, el rendimiento de esta nueva tecnología es particularmente intrigante en el cáncer de páncreas, para el cual las tasas de mortalidad son muy altas porque generalmente se diagnostica cuando está en una etapa avanzada“.
Fuente: ESMO
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